针对k-r算法是一种识别病原体基因组的算法基础工具。
属于基因重组中的重要技术。
基本上每一个涉及到基因重组的人员都会涉及其运用。
本科学生掌握工具的使用不难,但理解深层逻辑还有一定难度,更别提改良这种算法工具。
李涧的论文可以优化基因串行比对算法,提高病原体基因组的识别效率,加快基因组的数据分析速度,并作出详细注释。
大大缩短生物实验的前期准备时间。
这种算法类的论文,不需要太多的数据支持,可以不用进行太多的实验,取一部分先前两个月时间内做过的实验数据,就能够满足论文的数据支持。
最重要的还是涉及到数学以及编程算法方面的编写,这对于一个前世已经非常成熟的工具来说,非常的简单
只需要将蓝星的工具稍微削减一部分的功能之后,编写出来即可。
涉及到的数学、计算机学的知识都不是很难。
李涧有了思路之后,很快沉浸在了论文的编写过程之中。
通过对蓝星的工具进行解析,获取了许多先进的理念,对自身现有的学识不足,有了更深层次的了解。
特别是在数学计算以及计算机编程方面,还有很大的缺陷。
内核代码放在面前,都搞不懂其中所代表的意义。
“这是你写的论文,怎么会想到这个方向?虽然跟生物信息学有一定关联性,但更偏向于基因重组的方向。”
忽然,一个熟悉的声音从身后响起。
李涧转头看过去,发现导师周靖学教授已经站在了自己的身后,不知道有多久的时间。
“对,老师……我最近的实验已经完成了,所以就打算根据实验获取的数据,写一篇论文,看看能不能投稿出去。”
李涧回答道。
他们现在还是大三下学期的学生,没有确定毕业论文题目。
不过学校有一个规定,凡是投稿国内顶级期刊的论文或者各类竞赛获奖的论文都能够作为毕业论文进行毕业答辩。
目前生物系专业的学科大学生竞赛已经报名截止,就算可以保命,前身是一个学渣,在系里也找不到队友,没办法参赛。
剩下的路只有学术期刊投稿了。
“你对基因重组技术很熟悉吗?”
周靖学询问道。
以本科阶段的基因重组知识积累,暂时还做不到这种程度。
他很早就到了实验室里面,原本只是为了拿一样生物材料,但看见李涧在认真的写论文,忍不住凑过去看了几眼。
这一看就被吸引住了。
没想到自己这个刚刚招收的大三学生,竟然试图改进病原微生物的基因组鉴定方法。
每一种全新的分析方法构建,都需要非常庞大的计算资源,以及长期大量的临床检验场景的数据支持。
属于一种繁琐又精细的科研项目。
原本打算斥责一番。
但随着对方写论文的逐渐呈现出来,他竟然感觉到了一丝醍醐灌顶的错觉。
这学生改进的算法从思路上看,并没有什么大问题。
甚至连仿真数据都跑出来了……
“恩,老师,我最近做的基因重组实验,正好运用到较多的bst,这种工具分析基因数据太过繁琐了,大部分的实验都用在了基因组的解析上面。”
“所以我就有了一种想法,改进一下bst工具,创造一种更高效的分析工具。”
李涧回答道,这是他早就想好的说法。
不过为了堵住这个说法之中的漏洞,他最近需要好好的恶补一下数学跟编程方面的知识。
“仿真数据看上去倒是没有多大的问题,充当毕业论文足够了,但那可就太可惜了。”
“如果补全临床数据,彻底的验证你论文仿真数据之中的结论正确可行的话,足以发表一篇顶刊。
你加我一下微信,回头我将隔壁医学院的同学推给你,你自己联系一下,沟通临床研究的事情!”
周靖学拿出手机,打开了微信扫一扫递了过来。
李涧迅速的拿出手机打开了微信,加之了好友。
“过程中遇到什么问题都可以来找我,或者找程颐,他是我手底下的博士生,算是你们的大师兄。”
“不错,好好努力,论文写好了,我可以帮你看看。”
周靖学听到了微信好友通过的提示音后,拍了拍李涧的肩膀,笑着说道,一改平常冷脸待人的模样,变得十分的宽和。
原本不打算带本科生了,但是学校那边已经安排下来,他也没有拒绝。
没想到竟然遇到一个不错的苗子。
根据李涧所写的仿真数据来看,论文所改进的算法完全具备可行性。
从他对这份数据的处理来看,在基因重组方面的知识比一些硕士研究生都要深入一些。
现有的bst生物大分子对比工具是大洋对面的世界第一大国国家生物技术信息中心研究出来的顶尖工具,目前市场上主流的生